Przedmiotem zamówienia jest wyposażenie Stanowiska Zaawansowanych Technik Mikroskopii Wysokorozdzielczej, tworzonego w ramach Laboratorium Wysokorozdzielczego Obrazowania w Badaniach Translacyjnych, w oprogramowanie pozwalające na analizę danych otrzymywanych przy pomocy aparatury zakupionej w projekcie, co najmniej w okresie trwałości projektu „Infrastruktura obrazowania biologicznego i biomedycznego – Bio-Imaging Poland” - KPOD.01.18-IW.03-0017/23. Zamówienie zostało podzielone na następujące części: 1. Dostawa oprogramowania do interaktywnej analizy danych uzyskanych metodami bioobrazowania (część nr 1 zamówienia) 2. Dostawa oprogramowania do analizy i rekonstrukcji danych uzyskanych metodami bioobrazowania z algorytmem dekonwolucji obrazów (część nr 2 zamówienia) 3. Dostawa oprogramowania do obróbki danych uzyskanych metodami bioobrazowania z algorytmami szkolenia własnych modeli opartych o metody sztucznej inteligencji (część nr 3 zamówienia) 4. Dostawa oprogramowania do bioobrazowania i analizy zachowania zwierząt laboratoryjnych na podstawie akwizycji obrazu (część nr 4 zamówienia)

Część nr 1 - Dostawa oprogramowania do interaktywnej analizy danych uzyskanych metodami bioobrazowania

Przedmiotem zamówienia jest zakup przez Zamawiającego oprogramowania do interaktywnej analizy danych uzyskanych metodami bioobrazowania, umożliwiającego analizę danych pochodzących z mikroskopów zakupionych w ramach przedsięwzięcia Bio-Imaging Poland. Przedmiotem zamówienia jest dostawa oprogramowania, które: 1) Będzie działać w oparciu o licencję pływającą (floating licence), pozwalającą na uruchamianie oprogramowania na różnych komputerach i stacjach roboczych, zarówno lokalnie, jak i z wykorzystaniem połączenia przez zdalny pulpit; 2) Posiadać będzie aktualne funkcjonalności dostępne na rynku dla tego typu oprogramowania, w szczególności w zakresie: a) wizualizacji i analizy obrazów 3D i 4D, b) segmentacji obiektów biologicznych, c) analizy ilościowej danych przestrzennych, d) eksportu i importu danych w powszechnie stosowanych formatach obrazowania mikroskopowego, e) integracji z istniejącą infrastrukturą IT Zamawiającego. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia, w tym minimalnych parametrów techniczno-funkcjonalnych oraz innych wymagań dotyczących przedmiotu zamówienia zawarty jest w kolumnie B Tabeli Załącznika nr 2.1 do SWZ_Parametry. Opis sposobu wykonania zamówienia zawarty jest w Załączniku do SWZ - Projekt umowy.

Część nr 2 - Dostawa oprogramowania do analizy i rekonstrukcji danych uzyskanych metodami bioobrazowania z algorytmem dekonwolucji obrazów

Przedmiotem zamówienia jest zakup przez Zamawiającego oprogramowania do analizy i rekonstrukcji danych uzyskanych metodami bioobrazowania z algorytmem dekonwolucji obrazów umożliwiającego analizę danych pochodzących z mikroskopów zakupionych w ramach przedsięwzięcia Bio-Imaging Poland. 1) Oprogramowanie objęte zamówieniem powinno być kompatybilne i pozwalać na integrację z posiadaną przez Zamawiającego infrastrukturą IT w zakresie technicznym i systemowym, obejmującą systemy operacyjne Windows 10/11 oraz serwery w środowiskach Linux/Windows Server, oraz zapewniać możliwość pracy w oparciu o: co najmniej dwie licencje typu licencja pływająca (ang. floating licence), pozwalające na korzystanie z oprogramowania z dowolnego komputera przez co najmniej dwóch użytkowników jednocześnie. 2) Oprogramowanie powinno zapewniać funkcjonalności umożliwiające: a) dekonwolucję i rekonstrukcję obrazów mikroskopowych 2D, 3D i 4D, b) analizę danych z posiadanych przez Zamawiającego mikroskopów fluorescencyjnych konfokalnych, szerokopolowych, wielofotonowych, STED, SPIM, SoRa, Airyscan, STED z detektorem wieloelementowym i innych porównywalnych systemów, w tym z nowych mikroskopów zakupionych w ramach przedsięwzięcia Bio-Imaging Poland, c) korekcję aberracji chromatycznej i tła, d) analizę kolokalizacji, obiektów i trajektorii, e) wizualizację danych (rendering powierzchniowy, ortogonalny, maksymalna projekcja intensywności), f) tworzenie filmów, raportów i zestawień z analizy danych, g) obsługę danych wielowymiarowych (czas, kanały fluorescencji, serie obrazów w osi z, składanie obrazów z wielu pól widzenia), h) automatyzację analizy poprzez przetwarzanie wsadowe lub skrypty użytkownika. 3) Oprogramowanie powinno umożliwiać import i eksport danych co najmniej w formatach plików pochodzących z systemów mikroskopowych posiadanych przez Zamawiającego obejmujących głównych producentów systemów mikroskopowych. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia, w tym minimalnych parametrów techniczno-funkcjonalnych oraz innych wymagań dotyczących przedmiotu zamówienia zawarty jest w kolumnie B Tabeli Załącznika nr 2.2 do SWZ_Parametry. Opis sposobu wykonania zamówienia zawarty jest w Załączniku do SWZ - Projekt umowy.

Część nr 3 - Dostawa oprogramowania do obróbki danych uzyskanych metodami bioobrazowania z algorytmami szkolenia własnych modeli opartych o metody sztucznej inteligencji

Przedmiotem zamówienia jest dostawa oprogramowania do obróbki danych uzyskanych metodami bioobrazowania z algorytmami szkolenia własnych modeli opartych o metody sztucznej inteligencji, umożliwiającego analizę danych pochodzących z mikroskopów zakupionych w ramach przedsięwzięcia Bio-Imaging Poland. Oprogramowanie musi pozwalać na jednoczesne użycie: co najmniej dwóch stanowisk w wersji chmurowej, z dostępem przez przeglądarkę internetową lub dedykowaną aplikację. Wszelkie odniesienia do nazw handlowych, znaków towarowych, patentów lub pochodzenia produktów należy rozumieć jako przykładowe, a Zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne zapewniające pełną funkcjonalność opisaną w niniejszym dokumencie. Wszelkie odniesienia do nazw handlowych, znaków towarowych, patentów lub pochodzenia produktów należy rozumieć jako przykładowe, a Zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne zapewniające pełną funkcjonalność, nie gorszą niż opisaną w niniejszym dokumencie. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia, w tym minimalnych parametrów techniczno-funkcjonalnych oraz innych wymagań dotyczących przedmiotu zamówienia zawarty jest w kolumnie B Tabeli Załącznika nr 2.3 do SWZ_Parametry. Opis sposobu wykonania zamówienia zawarty jest w Załączniku do SWZ - Projekt umowy.

Część nr 4 - Dostawa oprogramowania do bioobrazowania i analizy zachowania zwierząt laboratoryjnych na podstawie akwizycji obrazu

Przedmiotem zamówienia jest zakup przez Zamawiającego oprogramowania do bioobrazowania i analizy zachowania zwierząt laboratoryjnych na podstawie akwizycji obrazu, działającego w oparciu o licencję pływającą lub na przenośnym kluczu sprzętowym, wraz z pakietami obejmującymi co najmniej następujące moduły lub równoważne funkcjonalności: 1) analiza barwy i kontrastu obrazu, 2) analiza ruchu i aktywności, 3) integracja z danymi zewnętrznymi, 4) analiza interakcji między obiektami. Oprogramowanie musi: 1) działać w oparciu o licencję wieczystą dla co najmniej jednego użytkownika, 2) opierać się na licencji pływającej lub licencji z przenośnym kluczem sprzętowym, pozwalającym na uruchamianie oprogramowania na różnych komputerach i stacjach roboczych, w tym z wykorzystaniem połączenia zdalnego. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia, w tym minimalnych parametrów techniczno-funkcjonalnych oraz innych wymagań dotyczących przedmiotu zamówienia zawarty jest w kolumnie B Tabeli Załącznika nr 2.4 do SWZ_Parametry. Opis sposobu wykonania zamówienia zawarty jest w Załączniku do SWZ - Projekt umowy.